Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PNMA8BQ9ULN7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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