Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NRXN1Q9ULB1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms