Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms