Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO3A1Q9UIG8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO3A1Q9UIG8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms