Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms