Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms