Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP68Q9UHB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP68Q9UHB9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP68Q9UHB9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP68Q9UHB9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP68Q9UHB9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRP68Q9UHB9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms