Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NXF1Q9UBU9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXF1Q9UBU9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms