Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNAL1Q9UBT7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms