Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms