Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARHGAP28Q9P2N2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms