Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RRBP1Q9P2E9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms