Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HCN3Q9P1Z3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms