Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKD2L1Q9P0L9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms