Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMOD2Q9NZR1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TMOD2Q9NZR1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMOD2Q9NZR1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMOD2Q9NZR1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMOD2Q9NZR1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMOD2Q9NZR1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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