Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf78Q9NZ63 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms