Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms