Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHDC1Q9NTX5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms