Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMILIN3Q9NT22 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMILIN3Q9NT22 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms