Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms