Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC6A13Q9NSD5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms