Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms