Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms