Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTA1Q9NP79 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTA1Q9NP79 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms