Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F12Q9HCS2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms