Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOBEC3GQ9HC16 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms