Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARV1Q9H2C2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms