Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIL1Q9H173 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIL1Q9H173 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms