Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF541Q9H0D2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF541Q9H0D2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms