Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPF3BQ9BZI7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPF3BQ9BZI7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms