Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM55Q9BYV6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM55Q9BYV6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms