Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARD11Q9BXL7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms