Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms