Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAP1Q9BWH6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP1Q9BWH6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms