Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NICN1Q9BSH3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NICN1Q9BSH3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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