Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RHOXF2Q9BQY4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms