Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RETNLBQ9BQ08 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms