Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VAT1Q99536 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAT1Q99536 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms