Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIGSQ96S52 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIGSQ96S52 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms