Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms