Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EAF1Q96JC9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms