Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS6Q96GS4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS6Q96GS4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms