Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms