Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM12Q96EX1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms