Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
EAF2Q96CJ1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EAF2Q96CJ1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms