Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C12orf43Q96C57 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C12orf43Q96C57 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms