Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UTP4Q969X6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UTP4Q969X6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms