Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTSSAQ969W0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTSSAQ969W0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms