Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRIM63Q969Q1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRIM63Q969Q1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM63Q969Q1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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