Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRUQ92729 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms